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公司建筑遗产保护规划与设计研究所创办于2005年，依托东南大学建筑学院、城市和建筑遗产保护教育部重点实验室（东南大学）和东南大学建筑设计研究院有限公司的雄厚实力，从事工程项目、科研、教学为一体的遗产保护专业设计工作。公司是国家文物局首批颁发全国重点文物保护单位保护规划和设计甲级资质的15家设计单位之一。
该所自创办以来，承担了大量重点遗产保护规划和修缮设计项目，在遗产保护方面，已完成项目类型涵盖有世界遗产、全国重点文物保护单位以及大量省、市级文保单位的保护规划和修缮设计项目；也包括名城及历史文化街区的保护规划及详细设计，风景区、遗址公园规划与设计，以及历史建筑的保护改造工程。在文化建筑领域，成果涵盖大型仿古建筑及群落，大型寺庙，楼阁等景观建筑、中小型博物馆，文化旅游展示建筑等多样类型，完成项目均成为地区的文化性标志建筑。设计成果多次获得国家级及省级优秀工程奖项。在科研方面，参与完成《江苏省历史文化街区保护规划编制导则》、《常州历史建筑保护修缮导则》，承担国家自然科学基金项目《中国建筑遗产资源评估模式研究》、《东南地区若干濒危和失传的传统建筑工艺研究》等教育部、国家文物局和江苏省的一系列遗产相关科研课题。